Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms