Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC010538.1-201ENST00000615131 663 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 STMND1-203ENST00000536551 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PHF7-202ENST00000347025 1472 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD1-201ENST00000367149 604 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GPN2-201ENST00000374133 715 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM211-202ENST00000423535 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P16-201ENST00000452798 171 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms