Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ANKRD42Q8N9B4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC246817.2-201ENST00000523971 577 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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