Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms