Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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