Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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