Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MCAMP43121 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms