Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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