Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms