Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms