Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZNF780A-206ENST00000595687 3472 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC090525.2-201ENST00000551685 2270 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 NCOA7-209ENST00000444128 2978 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC01133-203ENST00000635112 1996 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AGBL2-203ENST00000525123 3577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AOAH-211ENST00000617537 2381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 OR10K1-206ENST00000641971 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 HEPACAM2-204ENST00000453812 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 NVL-212ENST00000469968 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AP001180.1-201ENST00000562202 3566 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 HIP1-207ENST00000616821 3120 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 BDKRB2-203ENST00000554311 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 MMP2-208ENST00000570308 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 CSF1R-201ENST00000286301 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 CABYR-218ENST00000627314 1622 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRHP20396 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 ARMC4-201ENST00000305242 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC005035.1-201ENST00000627215 3727 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 HFE-207ENST00000357618 5286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRHP20396 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms