Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRHQ9HD43 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms