Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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SEMA4CQ9C0C4 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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