Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms