Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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UBXN4Q92575 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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