Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LRIG3Q6UXM1 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
LRIG3Q6UXM1 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms