Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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