Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms