Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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