Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms