Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TTPAP49638 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TTPAP49638 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TTPAP49638 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TTPAP49638 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms