Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRCP08575 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRCP08575 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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