Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms