Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FANCFQ9NPI8 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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