Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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