Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms