Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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NRF1Q16656 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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