Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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