Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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SYCP1Q15431 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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SYCP1Q15431 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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SYCP1Q15431 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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