Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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