Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC010542.3-202ENST00000561728 701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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