Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
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