Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms