Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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GPS1Q13098 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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GPS1Q13098 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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