Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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