Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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PTPREP23469 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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