Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms