Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KATNB1Q9BVA0 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms