Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms