Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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