Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
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CNGB1Q14028 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
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CNGB1Q14028 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
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CNGB1Q14028 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
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CNGB1Q14028 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
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