Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms