Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms