Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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HOXD10P28358 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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