Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms