Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms