Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 THNSL1-202ENST00000524413 3788 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 PIGFP1-201ENST00000519180 653 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC003080.1-201ENST00000413552 767 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 SMYD1-202ENST00000438570 680 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
CSPP1Q1MSJ5 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms