Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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