Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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