Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PRKCHP24723 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PRKCHP24723 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PRKCHP24723 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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PRKCHP24723 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PRKCHP24723 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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